Представлены результаты анализа современной литературы и собственных многолетних исследований, посвященных различным аспектам взаимодействий вирусов, микроорганизмов окружающей среды и микробиоты с иммунной системой организма человека в разные периоды его онтогенеза. Рассмотрены вопросы развития иммунопатологии, связанной с изменениями условий развития организма, среды его обитания. Проанализированы периоды раннего онтогенеза начиная с антенатального, интранатального, раннего детского и дошкольного, течение которых происходило в условиях благополучия и неблагополучия, в том числе инфекционного и социального. Особое внимание уделено оценке течения беременности у женщин, состояния их здоровья и плода, состояния здоровья детей, родившихся в разных условиях. Представлены патогенетические схемы взаимодействия микро- и макроорганизма, матери и плода, а затем и рожденного ею ребенка. Разработаны программы повышения эффективности профилактики заболеваний у беременных женщин и детей раннего возраста, которые основаны на полученных данных, послуживших критериями оценки состояния здоровья организма женщины и ребенка, его регуляторных систем, включая центральную нервную, вегетативную нервную, иммунную. Представлена характеристика течения вирусных инфекций в разные периоды онтогенеза и при разном состоянии иммунной системы, а также результаты исследований по оценке роли вирусных инфекций в формировании невирусных патологических процессов, что является попыткой решения одного из важнейших вопросов перинатологии. Описаны патогенетические процессы формирования феномена частых повторных инфекций, происходящих в разных условиях, в том числе социальных, у так называемых часто и длительно болеющих детей. Представлен анализ вариантов иммунотропных воздействий на организм детей, результаты экспериментов на лабораторных животных и культурах клеток. Разработанный авторами на основе собственных исследований патогенетический подход к прогнозированию и предупреждению развития инфекционной и неинфекционной, но вирусиндуцированной патологии, закономерностей инфицирования и развития патологии у детей, путей повышения эффективности профилактических мероприятий и гармонизации системы мать-плод-ребенок может быть использован органами здравоохранения, а также акушерами, педиатрами, неонатологами, иммунологами, вирусологами и другими специалистами для повышения эффективности мероприятий по борьбе с вирусными инфекциями и иммунозависимой патологией. Изложенный материал может послужить основанием для дальнейших исследований в области иммунологии и вирусологии.