Действующая с начала 2019 года Стратегия пространственного развития Российской Федерации, согласно результатам ряда отечественных исследований, слабо проработана как в теоретическом, методологическом плане, так и методически. В статье рассмотрены методологические аспекты управления развитием региональной пространственно-отраслевой структуры, раскрывающие методологию пространственного развития с точки зрения концепции устойчивого развития в региональном пространственно-отраслевом разрезе. Предложена методологическая схема балансировки параметров устойчивого развития региональной пространственно-отраслевой структуры.