В монографии представлена концепция исследования структурной и пространственно-временной динамики региональных социально-экономических систем на основе различных методологических подходов. В работе предложена методология прогнозирования развития макрорегионов на основе балансовых моделей, разработаны теоретические схемы согласования долгосрочных стратегических решений в многоуровневых иерархических системах, к которым относится региональная социально-экономическая система. Монография содержит результаты исследований предпосылок долгосрочного экономического прогноза макрорегионов, устойчивости инновационной динамики в процессе расширенного воспроизводства на примерах отдельных субъектов Уральского и Сибирского федеральных округов. Представлены модели межрегиональных и межотраслевых взаимодействий. В заключение авторами затронуты основные положения по мерам федеральной и региональной государственной поддержки на различных этапах циклического развития экономики. Монография предназначена для работников научно-образовательных и инновационных организаций, исполнительных органов власти при оценке целесообразности государственной поддержки инновационных инициатив и разработке стратегических документов долгосрочного развития.