С использованием новой информации, полученной с применением современных методов исследования, рассмотрены некоторые теоретические вопросы, касающиеся минералогии и геохимии неорганического вещества (НОВ) ископаемых углей. Особое внимание уделено новейшим исследованиям микро- и наноминералов в углях с помощью электронного и ионного микрозондирования, подчеркнута необходимость разграничения модальных и виртуальных форм нахождения элементов-примесей (ЭП). Введено базовое понятие об углефильных ЭП (взамен прежнего понятия «типоморфных ЭП»). Проведен системный анализ геохимии ЭП на трех иерархических уровнях организации геохимических систем: угольного пласта, угольных месторождений и угленосных бассйнов.