Исследовано видовое разнообразие бактерий активного ила биологических очистных сооружений (БОС) г. Перми, трансформирующих цианопиридины и амиды пиридинкарбоновых кислот. Методом накопительных культур на минеральной среде с 3-цианопиридином как единственным источником углерода и азота выделены 32 клона грамотрицательных гетеротрофных бактерий, дающих умеренный рост при пересевах на жидкой и плотной синтетической минеральной среде с 3- и 4-цианопиридином. По результатам анализа секвенированых фрагментов гена 16S рРНК клоны с не менее, чем 99% гомологией отнесены к родам Acinetobacter, Alcaligenes, Delftia, Ochrobactrum, Pseudomonas, Stenotrophomonas, Xanthobacter. Посредством ПЦР анализа было выявлено, что 13 из 32 изолятов имеют последовательности размером около 1070 п.н., гомологичные генам нитрилаз, ранее обнаруженным у Alcaligenes faecalis JM3 (GenBank, D13419.1). Способность трансформировать нитрилы и амиды при росте на минимальной солевой среде обнаружена у 9 клонов; Acinetobacter sp. 11h и Alcaligenes sp. osv трансформировали 3-цианопиридин до никотинамида, а подавляющее большинство клонов обладали амидазной активностью, которая составляла от 0.5 до 46.3 ммоль/г ч по ацетамиду и от 0.1 до 5.6 ммоль/г ч по никотинамиду. Подтверждена утилизация никотинамида штаммом A. faecalis 2, сопровождающаяся выделением в среду вторичного метаболита, с вероятностью 91% идентифицированного как додецил акрилат.
Species diversity of bacteria from the activated sludge of Perm biological waste treatment facilities capable of transformation of cyanopyridines and amides of pyridinecarboxylic acids was investigated. Enrichment cultures in mineral media with 3-cyanopyridine as the sole carbon and nitrogen source were used to obtain 32 clones of gram-negative heterotrophic bacteria exhibiting moderate growth on solid and liquid media with 3- and 4-cyanopyridine. Sequencing of the 16S rRNA gene fragments revealed that the clones with homology of at least 99% belonged to the genera Acinetobacter, Alcaligenes, Delftia, Ochrobactrum, Pseudomonas, Stenotrophomonas, and Xanthobacter. PCR analysis showed that 13 out of 32 isolates contained the sequences ( -1070 bp) homologous to the nitrilase genes reported previously in Alcaligenes faecalis JM3 (Gen-Bank, D13419.1). Nine clones were capable of nitrile and amide transformation in minimal salt medium. Acinetohacter sp. 11h and Alcaligenes sp. osv transformed 3-cyanopyridine to nicotinamide, while most of the clones possessed amidase activity (0.5 to 46.3 mmol/(g h) for acetamide and 0.1 to 5.6 mmol/(g h) for nicotinamide). Nicotinamide utilization by strain A. faecalis 2 was shown to result in excretion of a secondary metabolite, which was identified as dodecyl acrylate at 91% probability.