В статье рассматривается проблема методологического сопровождения процесса региональных налоговых льгот. В качестве объекта анализа был выбран метод оценки налоговых льгот, принятый в Пермском крае, поскольку относительно длительный период применения льгот позволил выстроить достаточную статистическую базу. В статье исследуется достоверность оценки бюджетной, экономической, инвестиционной и социальной эффективности льгот применения на основе Метода. Сформулированы предложения по его совершенствованию