В статье проанализированы используемые в экономической практике методики оценки последствий для отдельных регионов вступления России в ВТО, определены их плюсы и минусы, а также возможность использования для корректировки социально-экономической политики тех или иных территорий. Доказана фрагментарность проводимых ранее исследований. Приведены современные региональные инициативы в плане разработки методики и оценки последствий присоединения России к ВТО. Представлено авторское исследование по корректировке параметров программы развития отдельных муниципальных образований Алтайского края (с использованием опыта регионов) в связи с присоединением России к ВТО