В статье оценена изученность проблемы формирования институциональных основ инновационного недропользования в арктической зоне, обоснована актуальность исследований данной проблематики по приоритетным направлениям развития Арктики, определен и уточнен понятийный аппарат исследуемых приоритетов. Обозначены основные институты, механизмы и инструменты, способные оптимально регулировать инновационное недропользование. К числу общих инструментов отнесены: нормативно-правовой, программно-проектный, организационный и финансовый. Разработан методический подход к оценке уровня институциональных основ инновационного недропользования и его влияния на социально-экономическое развитие территорий стран, осваивающих Арктику. Выполнена оценка потерь потенциальной валовой стоимости, обусловленных неполнотой развития институциональных основ недропользования, препятствующей освоению минерально-сырьевого потенциала арктических территорий. Обозначены направления возможного сотрудничества России с арктическими странами в части дальнейшего развития институциональных основ недропользования в арктической зоне.